A sinistra, nei locali che attualmente ospitano la biblioteca, si trovava la Stanza delle Udienze al cui interno è ancora visibile la scritta “Odi l’altra parte” che invitava i giudici all’oculata analisi dei fatti; all’interno del secondo atrio, subito dopo l’arco sulla destra, l’affresco l’Incredulità di San Tommaso è un ulteriore suggerimento di accurata riflessione per chi era incaricato del giudizio.

L’atrio si affaccia sulla corte con la loggia, offrendo una visione d’insieme delle mura interne e del cassero; sul lato sinistro, il pozzo, con una profondità di oltre 30 m., assicurava un approvvigionamento costante ai residenti dell’edificio e agli abitanti. Un altro pozzo era presente nella piazza fino all’inizio del secolo scorso.
Attraverso gli stemmi è possibile talvolta ripercorrere significativi eventi della storia di questo territorio: ad esempio, ancora nel primo atrio, sul lato destro, a fianco della finestra, la sola testimonianza finora nota di successione familiare di un Vicario che perì durante il terremoto del 1542 e che fu eccezionalmente sostituito dal figlio. Gli studi finora svolti sulla serie degli stemmi del Palazzo collocano i più antichi nel secondo atrio, tra i quali, sul lato destro della porta di accesso alla scala, quello del Vicario Cece da Verrazzano (1412) che commissionò anche il maestoso San Cristoforo all’inizio della scala.

Sempre nel secondo atrio sono presenti anche gli stemmi delle varie Podesterie e quelli che rimandano alla città di Firenze; osservando in alto a destra del grande arco che introduce alle scale si possono riconoscere: la croce rossa in campo bianco, che rappresenta la Croce del Popolo, il giglio rosso in campo bianco ovvero la Repubblica Fiorentina, l’aquila che rimanda ai conflitti tra Guelfi e Ghibellini. Oltre ad insigni famiglie nobili, ricoprirono la carica di Vicario importanti figure della storia letteraria fiorentina, quali Giannozzo Manetti, umanista fiorentino del primo Quattrocento, Matteo Palmieri, il cui stemma è visibile sulla volta esterna all’ingresso alla scala, Giovanni di Paolo Morelli, anch’egli figura di rilievo politico e storico tra XIV e XV secolo, il cui stemma a targa da torneo è visibile sotto il primo arco della parete sinistra.

Proseguendo si giunge nella corte. Questa era ancora parte dello spazio ad uso pubblico, progettata anche allo scopo di contenere gli abitanti della terra nuova qualora si presentassero situazioni di pericolo. Sul lato sinistro è presente una loggia il cui interno è arricchito da altre significative testimonianze nobiliari; una sosta merita la cosiddetta Madonna di Montaccianico.

Il piano nobile del palazzo si raggiunge con una ripida scala introdotta dal significativo simbolo fiorentino del “Leone Marzocco” che troviamo scolpito in pietra sul lato destro e che ribadisce il legame con Firenze. Il leone solitamente stringe tra le possenti zampe lo stemma fiorentino, sorvegliando e proteggendo il giglio rosso, emblema della città. In questo caso però troviamo lo scudo del Vicario Bucelli presente nel 1416 quando la scala forse fu appena realizzata. Sebbene incerta, l’origine di questo animale totemico come protettore di Firenze deriverebbe proprio dalle radici romane del capoluogo toscano.

Il leone fu scelto dalla Repubblica fiorentina a dimostrazione della potenza politica: questo animale infatti sarebbe stato l’unico in grado di uccidere l’aquila, allora simbolo imperiale, nonché dell’odiata Pisa. Ancora oggi la figura di questo animale è presente nei luoghi più disparati della città, dalla banderuola di Palazzo Vecchio fino a quelli in pietra a guardia del parco delle Cascine, oppure nei lampioni dalle zampe leonine che illuminano i lungarni proteggendo la città e il suo fiume.

Sulla prima rampa di scale il San Cristoforo. Sempre in questi ambienti sono state raccolte le sinopie di alcuni affreschi staccati; in particolare spicca entrando a destra quella della Maestà incontrata nell’atrio mentre sul lato sinistro la prima sinopia rappresenta San Cristoforo e la seconda il San Tommaso.

Salendo, sull’arco che sovrasta la seconda rampa di scale, troviamo un altro piccolo affresco raffigurante un’Annunciazione, incorniciata da graziose decorazioni vegetali e alla cui base si leggono gli stemmi di Giovanni Carnesecchi e Tommaso Cordelli. Alla sommità della scala lo stemma di Pagolo di Giovacchino Macigni introduce negli ambienti interni.